A kambodzsai hatóságok genetikai védőzónává nyilvánítják a sziámi krokodilok élőhelyét. Az intézkedés célja a faj utolsó vadon élő populációjának megóvása. A Nemzetközi Természetvédelmi Unió (IUCN) a kihalással fenyegetett fajok közé sorolja ezeket a hüllőket.
A sziámi krokodilok állományát a teljes múlt században súlyosan károsította a vadászat és a befogás. Az 1990-es évekre már úgy vélték, hogy a faj teljesen eltűnt. Kambodzsa nehezen megközelíthető mocsaras vidékeinek lakói azonban továbbra is arról számoltak be, hogy látnak még túlélő példányokat. A szakembereknek végül sikerült megtalálniuk azokat a helyeket, ahol fennmaradtak.
A védetté nyilvánított terület legalább negyven sziámi krokodil otthona és genetikai állományának természetes őrzőhelye lesz. Az élőhelyen különleges védelmi szabályokat vezetnek be.
A Fauna & Flora International természetvédelmi szervezet már 2011-ben tenyészközpontot alapított a faj megmentésére. Azóta több mint száz krokodilt engedtek vissza a vadonba. A folyamat azonban lassú: a fiatal állatoknak három-négy évre van szükségük ahhoz, hogy megerősödjenek, elérjék a megfelelő méretet, és képesek legyenek túlélni természetes környezetükben.
A szabadon engedett példányokat akusztikus jeladókkal látják el, így a helyi természetvédelmi őrök követhetik a mozgásukat. Az élőhelyet rendszeresen járőrözik is, hogy fellépjenek az orvvadászat és az illegális halászat ellen.
